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岛根开源战略的第二步是构建“产—学—官”的合作体系，希望建立产业界、学术界与政府机构之间的联动与合作机制，并以此作为实施开源战略的核心组织体系。此外，借助这一体系的建设，岛根县也投入了大量财力、人力进行Ruby语言方面的宣传与推广。
2006年，成立了岛根开源协会（Shimane Open Source Society），协会涵盖了岛根尤其是松江市的所有IT厂商和重要的开源研究人士，到2009年3月份，共有企业会员32名，其中县内企业26家、县外企业6家，个人会员11名，支持会员31名。岛根的开源协会兼具产业组合与“产-学-官”联合的特点。前者的表现是该协会涵盖了县内重要的IT厂商，活动之一是厂商之间的软件产业商务研讨会，彼此之间进行商务信息交换，讨论获取县外订单的可能性。例如，协会整合了岛根辖区内39家软件企业，共同向首都圈IT市场进发，扩大市场订单。根据企业技术能力和业务特点，划分为Ruby开发、系统开发、插件开发等合作分支组织，企业间结合成非正式的合作与交流机制。后者的表现是协会个人会员涵盖了政府官员、开源学者、IT技术人员等，协会的活动从整体上提高全县IT产业技术人员的能力和技术水平。
2007年7月，有限责任公司性质的Ruby协会（Ruby Association）成立，Ruby开发者松本行弘任理事长，岛根县知事、松江市市长任顾问。协会的主旨是推动Ruby的研发与普及，及时发布新的Ruby程序版本，为企业与个人用户使用Ruby进行程序开发提供技术支持等，其作用相当于太阳微系统公司（Sun Microsystems）之于Java语言，对Ruby语言的软件开发进行商业化。Ruby协会成立后，还要担负起支持建立和维护Ruby开发社区的责任，并于2007年12月开创了Ruby工程师认证项目，负责开展Ruby资格认证工作。总之，与Ruby直接相关的活动与职责基本上整合到了Ruby协会中，使之成为专门机构。自2009年起，召开Ruby世界会议（Ruby World Conference），邀请世界各地使用Ruby开发的优秀程序员和技术人员参加。
岛根开源协会还与岛根大学等机构合作，召开开源国际学术会议，如东亚开源论坛等，促成开源研究的国际化和国际合作。
地方政府在开源战略中起到了关键性的作用，并架起了产学沟通的桥梁。“产—学—官”协作的方式改变了日本IT业发展的模式，尤其在改善中小企业发展环境方面，取得了显著效果。过去的IT服务和软件订单，大部分是通过有来自东京、大阪等地的大软件厂商竞标获得，然后进行模块分解并分包给中小企业。这在产业集群方面有积极的一面，也有消极的一面。消极方面主要是中小企业与大企业之间存在一种依存关系，中小企业处于“卖主锁定”的状态，不利于中小企业的生存与创新。岛根的创新在于依托政府采购实施影响力，以官方参与的协会来获取订单，并向中小企业开放，鼓励中小企业之间竞争，支持中小企业发展壮大。归结起来，岛根的做法实质在于摆脱大企业对订单的控制权，从而为中小企业争取更大的生存空间和创新动力(310328,基金吧)，这与岛根县的产业形态以中小企业为主有关。
为了实现这一目标，促成企业间的联合，2008年2月，获得日本总务省支持的社会性网络服务项目“松江SNS”正式开通，进一步促进县内IT企业之间的联合。
岛根县将政府采购作为产业政策工具来贯彻政府的宏观政策，并作为战略决策的一部分。政府通过政府采购向当地的软件公司下订单，并探索政府工作人员参与软件设计与需求实现的方式。前面已经提到，岛根县政府采购的服务占当地GDP总值的六分之一左右，是当地拉动经济增长的重要力量。在开源战略中，岛根县促使辖区内所有市町村的信息系统均导入Ruby，提高Ruby为基础的开源软件的采纳率。政府的公共需求为当地软件公司提供了基础性的订单，进而提高当地软件公司的研发能力，进而提高当地软件公司与开源协会获得区域外信息服务订单的能力。
岛根县政府根据国家信息化推进处（隶属于经济产业省），与当地有关核心软件厂商合作，进行关于在政府机构、企业等基础信息系统中使用Ruby的可行性调查及研究，对Ruby基础系统的性能、特性做出评估，提供一整套系统方案、工具开发建议等，从而为岛根政府、企业和其他机构的开源采纳提供指导和帮助。同时，进行其他系统向Ruby的基础信息系统迁移的可行性、兼容性等技术问题评估。例如，2007年调查评估了开源软件构建的松江市医疗保健系统的性能。
岛根县政府还将地方官方网站开发使用的CMS架构（内容管理系统，Content Management System）变为开源。网络应用与传播研究中心帮助设计开发的岛根CMS架构于2006年4月开始运行，2008年2月后向社会公开源代码，其他地区的政府网页可以借鉴采用。岛根县政府也希望以此来宣传开源精神，塑造岛根的开源文化与开源形象。
岛根县政府也利用开源战略进行招商引资，吸引了6家县外软件公司迁移到松江办公。政府机构还积极整合产业振兴财团等金融资源，协调县内IT产业企业的融资问题，为实施开源战略提供金融支撑。
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